ประเภทตู้คอนเทนเนอร์ในการขนส่งสินค้ามีหลากหลายรูปแบบ เพื่อรองรับสินค้าที่มีขนาดและลักษณะแตกต่างกัน ทำให้สินค้าแต่ละประเภทสามารถขนส่งได้อย่างปลอดภัยและมีประสิทธิภาพ
ประเภทตู้คอนเทนเนอร์แต่ละประเภทก็จะมีดังนี้
Dry container เป็นตู้คอนเทนเนอร์แบบมาตรฐานจะใช้กับสินค้าทั่วไปหรือสินค้าที่ไม่ต้องควบคุมอุณหภูมิ
Ventilated container เป็นตู้คอนเทนเนอร์ที่มีช่องระบายอากาศอยู่ตรงขอบบนด้านข้างทั้ง 2 ฝั่งของตู้คอนเทนเนอร์เพื่อระบายอากาศ ซึ่งตู้ชนิดนี้จะเหมาะกับสินค้าที่จำเป็นต้องโดนอากาศเพื่อไม่ให้เกิดความเสียหาย เช่น เมล็ดกาแฟ เมล็ดโกโก้ และสินค้าที่มีความชื้นสูงอื่นๆ
Refrigerated container เป็นตู้คอนเทนเนอร์ควบคุมอุณหภูมิ ซึ่งภายอุณหภูมิภายในตู้คอนเทนเนอร์ก็จะมีตั้งแต่ -65 องศาเซลเซียส ถึง 40 องศาเซลเซียส ซึ่งจะเหมาะกับสินค้าประเภท พวกอาหาร ผลไม้ หรือสินค้าชนิดอื่นๆที่ต้องดูแลด้วยการควบคุมอุณหภูมิ
Garment or hanging container เป็นตู้คอนเทนเนอร์ที่ออกแบบมาเพื่อสำหรับขนส่งเสื้อผ้า ซึ่งตู้ชนิดนี้จะมีราวสำหรับแขวนเสื้ออยู่ เพื่อไม่ให้สินค้านั้นยับหรือเสียทรง
Open top container เป็นตู้คอนเทนเนอร์ที่มีลักษณะไม่มีหลังคาหรือข้างบนเปิดโล่งไว้ ซึ่งตู้ชนิดนี้จะเหมาะกับสินค้าที่มีความสูงพิเศษ
Flat rack container เป็นตู้คอนเทนเนอร์ที่ไม่มีที่ปิดด้านข้างและก็ด้านบน สามารถยืดและหดได้ เหมาะกับสินค้าที่มีความสูง ความกว้าง หรือขนาดใหญ่
Platform container จะมีลักษณะไม่มีหลังคาหรือด้านข้างเลย จะมีแบบฐานอย่างเดียว ซึ่งเหมาะกับสินค้าที่มีขนาดพิเศษที่ไม่สามารถบรรจุลงในตู้คอนเทนเนอร์ประเภทอื่นได้
Iso tank container เป็นตู้คอนเทนเนอร์ที่ออกแบบมาเพื่อไว้สำหรับขนส่งสินค้าที่เป็นของเหลวในปริมาณที่มาก ไม่ว่าจะเป็นสินค้าที่เป็นอันตรายหรือไม่เป็นอันตราย เช่น เครื่องดื่มต่างๆ สารเคมี